医保基金支付就是指医保报销的意思。缴纳了基本医疗保险的投保人，在发生指定的医疗费用之后且符合医保报销范围的前提下，由社会医保统筹基金来支付符合条件的医疗费用。比如参保人在医院发生的医疗费用5000元，其中有4000元是属于医保的保障范围，那么这个4000元的费用将有医保统筹基金来支付，剩下的1000元才是需要用户自己支付的费用。

医保基金支付并不是扣医保卡里面的钱，而是扣的统筹账户的钱。医保卡里面的钱是职工医保个人缴费的部分，通常情况下可以用于门诊及定点药店支付以及在完成医保报销后需要个人自付的费用。

城镇职工医疗保险最高报销额度。门诊报销：20000元。住院报销：30万元。城镇居民医疗保险最高报销额度。门诊报销：2000元。住院报销：17万元。

法律依据：《中华人民共和国社会保险法》第二十九条 参保人员医疗费用中应当由基本医疗保险基金支付的部分，由社会保险经办机构与医疗机构、药品经营单位直接结算。社会保险行政部门和卫生行政部门应当建立异地就医医疗费用结算制度，方便参保人员享受基本医疗保险待遇。